神经肿瘤外科主要开展脑深部功能区肿瘤、三四脑室肿瘤、鞍区肿瘤、桥小脑角及颈胸腰段脊髓肿瘤等神经系统肿瘤的外科手术，是中国脑胶质瘤分子诊疗联盟成员单位、国家区域医疗中心神经外科联盟成员单位、CSNO认证的肿瘤医院神经外科联盟成员单位。目前配备有手术显微镜、神经内镜、立体定向仪、超吸刀（CUSA)、等离子刀、术中彩超、术中C臂机、神经电生理监测仪等设备及美敦力气动、史赛克电动等动力系统。现有主任医师2名，副主任医师1名。

科室能够开展大、小脑半球胶质瘤、转移瘤、脑膜瘤、听神经瘤、颅咽管瘤、三叉神经鞘瘤、四脑室、侧脑室室管膜瘤、髓质母细胞瘤、血管母细胞瘤、颈胸腰段脊髓肿瘤等颅脑、脊髓肿瘤4级手术。多模态影像引导下的神经肿瘤精准微创手术治疗、基因分子病理指导下的个体化精准综合诊疗脑胶质瘤、脑转移瘤（尤其是脑膜转移，脑脊液播散等难治性转移瘤）的多学科综合诊疗等是科室诊疗特色。

科室注重临床、教学与科研相结合，承担福建医科大学理论教学及临床带教任务，定期组织参与院内、院际及区域间的疑难病例MDT讨论，参与多项国家级、省级多中心科研课题的临床研究，在SCI、国家级、CSCD等核心期刊发表论文30余篇。